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本发明公开一种制备吗替麦考酚酯的方法,包括以二丁醚为溶剂,在惰性气体保护下,恒沸除水条件下,MPA与2-羟乙基吗啉完成反应,获得麦考酚酯粗品;以离子液体为螯合剂进行脱色纯化,吗替麦考酚酯引晶,混合溶剂结晶,得到高纯吗替麦考酚酯。本发明具有反应时间短、MPM纯度高、反应收率高、生成成本较低等优点,并且解决终产物颜色问题,它具有广阔的工业化应用前景。